Si la conversion de caracteres es de una codificacion a otra yo haria lo
sugerido por Alvaro con el iconv, de lo contrario haria un pg_dump plano y
le pasaria un script en perl para luego restaurar.
Si lo que necesitas es en una sola tabla, entonces descargala con \copy en
un archivo de texto, pasale un script en perl que te haga los reemplazos (si
no es muy grande puedes hacerlo incluso con vi) y luego vuelves y la subes.
Saludos
Cristian.